El diagnóstico prenatal de gastrosquisis es muy probable en personal entrenado y con equipos adecuados de ultrasonografía obstétrica. Por otra parte, el diagnóstico de fetos con dextrocardia por ecografía, siendo éste muy difícil, por lo general se encuentra asociado a alguna enfermedad congénita; siendo ambas anomalías de muy baja incidencia, más aún asociadas a ventrículo único, entre otras.  La sobrevida y la calidad de vida del paciente con gastrosquisis va a depender del grado de exposición visceral y de la resolución quirúrgica que se le pueda ofrecer al mismo, de ser esta posible, sin tomar en cuenta las infecciones concomitantes que puedan traer la exposición intestinal del mismo; por otra parte, la vida del paciente con ventrículo único comienza a ser determinada en el momento del nacimiento. El diagnóstico y tratamiento precoz son fundamentales para proteger a los pulmones de la hipertensión pulmonar y al ventrículo de la miocardiopatía asociada a la sobrecarga de presión y volumen. Cuanto menos cianosis exista mayor sobrecarga de volumen e hipertensión pulmonar habrá, por lo tanto es necesario asegurar un flujo sistémico libre y regular el flujo pulmonar.