La aparición del primer electrocardiógrafo en Venezuela fue posible gracias a la iniciativa de Heberto Cuenca, quien durante su residencia en Francia, entendió la importancia que este instrumento tendría para el avance de la medicina venezolana. No obstante, como señala Bermúdez Arias: "De no haber sido por su labor docente, asistencial, académica y en especial por su labor de investigación clínica desarrollada con este revolucionario aparato, se hubiera interpretado su aporte tan sólo como una contribución".

Por ello el aporte más reconocido de Cuenca fue el realizado dentro la investigación clínica, hecho que lo condujo a dejar constancia de su obra a través de varias publicaciones: "Nota preliminar sobre electrocardiografía en Venezuela", "Nota sobre un caso de endocarditis bacteriana de origen amigdaliano", "Comunicación interventricular, con estrechez de la arteria pulmonar, y "Nota sobre un caso de angina de pecho de origen miocárdico", entre muchas otras más.

Desde temprano, Cuenca comienza su labor en el área de la investigación científica. En 1928 se inicia en la revista "La Beneficencia" de Maracaibo, con la publicación del trabajo "Variaciones de las especies leucocitarias en la infección gripal" y "La diazo-reacción de Erclich", trabajo publicado en la revista del Centro de Estudiantes de Medicina, de Caracas. Más tarde publica un nuevo trabajo de investigación titulado: "Segundo Caso de Espiroquetosis bronquial de Castellani observado en Venezuela" , junto con R. Torres Suels.

"Nota preliminar sobre electrocardiografía en Venezuela", es el primer trabajo de cardiología publicado en Venezuela. Según Fernando Bermúdez Arias, en esta publicación, Cuenca destaca la importancia del uso y manejo del electrocardiógrafo, particularmente en el estudio de las arritmias, práctica que en años anteriores era compleja y confusa. En "Nota sobre un caso de angina de pecho de origen miocárdico", Cuenca describe el caso de un paciente hipertenso con angina de pecho típica de origen miocardio.

En la publicación: "Nota sobre un caso de comunicación interventricular, con estrechez pulmonar", describe a un paciente de 24 años con una serie de afecciones del corazón: disnea, tos, expectoración sanguinolenta, signos de insuficiencia cardíaca congestiva. Luego de varios estudios concluye que hay aumento del arco pulmonar, crecimiento de la aurícula y del ventrículo derecho y ligero del ventrículo izquierdo. Establece el diagnóstico de "comunicación interventricular con estenosis de la válvula pulmonar y afección congénita del corazón. Con este estudio, nos cuenta Bermúdez Arias que Heberto Cuenca avizora el estudio de los primeros casos de cardiopatía congénita":

"Bastarían estas publicaciones para darse cuenta de la amplitud del conocimiento cardiológico de este médico, que sin ir más lejos, ya en ellos reflejaba varios aspectos de los múltiples campos nosológicos de la materia: la electrocardiografía como método de estudio, las cardiopatías congénitas, las infecciosas y las isquémicas. En ese lapso dejó marcada la huella imperecedera de los verdaderos fundadores, señal que lleváronlo a ser reconocido, en su tiempo, como factor fundamental del carácter académico y científico que siempre supo imprimir a sus actuaciones como médico y como investigador clínico".

Noventa fueron los trabajos que Cuenca realizó, y de ellos, treinta aproximadamente tratan el desarrollo de varios aspectos de la cardiología, publicados en la revista de la Sociedad Médico-Quirúrgica del Zulia (1927-1932), en Archivos Venezolanos de Cardiología y Hematología y en otras publicaciones médicas nacionales.