Se examinaron las biopsias de 15 mujeres con diagnóstico de neoplasia intraepitelial anal (NIA) y cáncer del canal anal. La muestras fueron estudiadas histológicamente y utilizando diversas técnicas de biologí­a molecular, hibridación in situ para VPH e hibridación genómica cromogénica comparada (HGC) en algunos de los casos. Los resultados señalan la importancia del VPH en el cáncer anal y a través de la HGC, demostramos alteraciones cromosómicas relacionadas con la pérdida de la heterocigosis implicada en el proceso de carcinogénesis.